Hoewel de Slowjuicer Groenten- en Fruitpers BPA-vrij over het algemeen positief scoort, zijn er ook enkele nadelen die aandacht verdienen. Zo is het koudpersmechanisme het nadeel van de relatief lage verwerkingssnelheid. Het persen gaat langzamer dan bij conventionele sapcentrifuges, wat voor mensen die haast hebben wellicht onpraktisch kan zijn. Voor dagelijkse gebruikers die snel een sapje willen zetten kan dit als frustrerend worden ervaren.
Daarnaast vergt het krachtig persen van zeer harde groenten zoals bieten of winterpenen soms wat extra inspanning, en het kan voorkomen dat de slowjuicer af en toe even stopt of vastloopt bij dikke stukken. Dit vereist soms dat je ingrediënten in kleinere stukken snijdt, wat de gebruiksvriendelijkheid iets vermindert.
Verder is de sapoutput relatief laag in vergelijking met sommige professionele modellen. Omdat het sap erg langzaam geperst wordt, kan het voorkomen dat er wat pulp overblijft in het sap, wat niet altijd gewenst is. Hoewel het pulp vrij droog is, is het apparaat minder geschikt voor mensen die zeer grote hoeveelheden sap in korte tijd willen produceren.
Tot slot zijn sommige gebruikers minder enthousiast over het beperkte aanbod in kleurkeuzes; wanneer je niet van de grafietkleur houdt, is er geen alternatief beschikbaar, waardoor het minder flexibel is qua esthetiek.